蒋兴鹏

作者: 来源:  时间:2016-12-14 23:11 浏览:


教师简介

 

蒋兴鹏,博士,教授,硕士生导师。1979年7月出生,2009年7月于中科院自动化所模式识别国家重点实验室获得博士学位,专业为模式识别与智能系统,师从蒋田仔研究员。先后于2009年8月-2012年1月在加拿大McMaster大学生物系、2012年2月至2014年12月在美国Drexel大学信息与计算学院从事博士后研究工作。2015年1月加入华中师范大学计算机学院,2015年入选湖北省“楚天学者”-楚天学子计划。


目前担任IEEE会员,中国计算机学会会员及中国生物工程学会会员,IEEE BIBM 程序委员会成员及SCI期刊International Journal of Data Mining & Bioinformatics编委, BMC Bioinformatics, BMC Genomics特刊编辑;第一届计算调控基因组学及宏基因组学研讨会发起人及会议主席,中医药大数据产业联盟理事。主要从事高维微生物组学数据分析和计算方法的研究,具体研究涉及网络分析和模拟中的计算方法、宏基因组学与自然环境或人类疾病的关联、大规模生物数据的集成、降维和可视化等领域。近五年来,在IEEE/ACM Transctions on Computational Biology and BioinformaticsJournal of Mathematical Biology, PLoS ONEFEBS Letters等学术期刊上发表SCIEI论文30余篇, 其中IEEE/ACM Transactions系列5篇,第一作者或通讯作者SCI论文11篇,封面论文一篇(FEBS Letters 

 

 联系方式:xpjiang@mail.ccnu.edu.cn



研究方向

生物大数据挖掘高维数据分析统计模式识别生物信息学时间序列分析

 

承担科研项目

1.参与国家自然科学基金重点项目(排名第三
名称:
高通量微生物组学数据模式提取和分析

项目编号:61532008,时间:2016年1月2020年12月

2. 参与湖北省科技支撑计划项目(对外科技合作类)

名称:微生物大数据挖掘及医学应用合作研究

项目编号:2014BHE0017,时间:2015年1月-2016年12月

3. 主持华中师范大学科研启动经费

名称: 高维微生物组学数据分析

项目编号:210-31102, 时间:2015年1月-2017年12月


 


近五年代表性论文:


            Jiang, X., X. Hu, and W. Xu, Microbiome Data Representation by Joint Nonnegative Matrix Factorization with Laplacian Regularization. Computational Biology and Bioinformatics, IEEE/ACM Transactions on, 2015. 

             Xu, W., et al., Visualization of genetic disease-phenotype similarities by multiple maps t-SNE with Laplacian regularization. BMC medical genomics, 2014. 7(Suppl 2): p. S1.

            Jiang, X., et al., Selecting Protein Families for Environmental Features Based on Manifold Regularization.  Nanobioscience, IEEE Transactions on, 2014. 13(2): p. 104-108.

             Jiang, X., et al., Predicting Microbial Interactions using Vector Autoregressive Model with Graph Regularization. Computational Biology and Bioinformatics, IEEE/ACM Transactions on, 2014.

            Jiang, X. and X. Hu, Inferring microbial interaction networks based on consensus similarity network fusion. Science China Life Sciences, 2014. 57(11): p. 1115-1120.

             Jiang, X., et al., Comparison of dimensional reduction methods for detecting and visualizing novel patterns in human and marine microbiome. NanoBioscience, IEEE Transactions on, 2013. 12(3): p. 199-205.

             Bartram, A., et al., Exploring links between pH and bacterial community composition in soils from the Craibstone Experimental Farm. FEMS Microbiology Ecology, 2013. 87(2): p. 403-415.

            Jiang, X., J.S. Weitz, and J. Dushoff, A non-negative matrix factorization framework for identifying modular patterns in metagenomic profile data. Journal of Mathematical Biology, 2012. 64(4): p. 697-711.

            Jiang, X., et al., Functional Biogeography of Ocean Microbes Revealed through Non-Negative Matrix Factorization.PLoS ONE, 2012. 7(9): p. e43866. 

            Last update:April 13, 2016


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