基本信息：

邮箱：zhaoyu@ccnu.edu.cn

教师职称：特任副研究员

个人简介：

方钊玉，女，中南大学计算机科学与技术博士，新加坡科技局（A*STAR）联合培养博士生，曾在新浪微博和腾讯担任算法工程师实习生，2025年12月入职华中师范大学计算机学院

研究方向：

AI4Science，人工智能与生物信息学，组学大模型

欢迎对生物信息计算、AI for Science感兴趣的本科生和研究生加入，一起成长一起进步！当前课题组主要研究方向为单细胞与空间多组学数据建模，具体课题包括：(1)细胞异质性分析；(2)细胞时空动态分析；(3)组学大模型和虚拟细胞。希望你已经具备熟练运用Python、C++和Pytorch等深度学习框架编程能力，对自监督学习、图神经网络、Transformer等深度学习技术有一定了解。鼓励学生参加数学建模等相关比赛，并且全力支持学生进行国内外学术交流！

科研项目：

[1] 湖南省研究生科研创新项目，基于单细胞测序技术的细胞分化轨迹推断方法研究，2022.02-2024.02，主持

[2] 国家自然科学基金杰出青年项目，生物信息计算，2023.01-2027.12，参与

[3] 国家自然科学基金国际(地区)合作与交流项目，单细胞多组学数据分析方法及在心脏重大疾病中的应用研究，2024.01-2028.12，参与

获奖与荣誉：

2015年全国大学生数学建模竞赛一等奖

2024年中南大学校长奖学金创新奖

学术兼职：

担任国际学术期刊及会议审稿人，包括Briefings in Bioinformatics，IEEE/ACM TCBB，BMC Bioinformatics，IEEE BIBM等

代表性论文：

[1] Fang Zhaoyu, Zheng Ruiqing, Li Min*. scMAE: a masked autoencoder for single-cell RNA-seq clustering[J]. Bioinformatics, 2024, 40(1): btae020.

[2] Fang Zhaoyu, Liu Teng, Zheng Ruiqing, Mingzhu Yin, Min Li*. stAA: adversarial graph autoencoder for spatial clustering task of spatially resolved transcriptomics[J]. Briefings in Bioinformatics, 2023, 25(1).

[3] Fang Zhaoyu, Lin Cuixiang, Xu Yunpei, Li Hongdong*, Xu Qingsong*. REBET: a method to determine the number of cell clusters based on batch effect removal[J]. Briefings in Bioinformatics, 2021, 22(6): bbab204.

[4] Liu Teng†, Fang Zhaoyu†, Zhang Zongbo, Yu Yongxiang, Li Min*, Yin Mingzhu*. A comprehensive overview of graph neural network-based approaches to clustering for spatial transcriptomics[J]. Computational and Structural Biotechnology Journal, 2024, 23: 106-128.

[5] Pan Xu, Li Xin, Dong Liang, Liu, Teng, Zhang Min, Zhang Lining, Zhang Xiyuan, Huang Lingjuan, Shi Wensheng, Sun Hongyin, Fang Zhaoyu, Sun Jie, Huang Yaoxuan, Shao Hua, Wang Yeqi, Yin Mingzhu*. Tumour vasculature at single-cell resolution[J]. Nature, 2024, 632(8024): 429-436.

[6] Ding Jiayuan, Lin Jianhui, Jiang Shiyu, Wang Yixin, Miao Ziyang, Fang Zhaoyu, Tang Jiliang*, Li Min*, Qiu Xiaojie*. Tabula: A Tabular Self-Supervised Foundation Model for Single-Cell Transcriptomics[C]//The Thirty-ninth Annual Conference on Neural Information Processing Systems.

[7] Fang Zhaoyu, Miao Ziyang, Lin Jianhui, Xie Yuying, Tang Jiliang, Ding Jiayuan*, Li Min*. scLinguist: A pre-trained hyena-based foundation model for cross-modality translation in single-cell multi-omics, https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2025.09.30.679123v1.

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